ITS ANALYSIS
MÉTODOS
Para establecer el mejor flujo de trabajo se siguieron varios flujos de trabajos según detalla la Figura 1.
Figura 1. Métodos
RESUMEN READS Y FEATURES
Según los diferentes métodos seguidos se obtuvieron diferentes resultados de número de reads y features (otus o asvs).
Table 1. Features y Reads totales por método
Table 2. Readas por muestra
Table 3. Reads por muestra removiendo singletons
Table 4. Número de taxas a cada nivel taxonómico
ALPHA DIVERSIDAD
Figura 2. Alpha diversidad a todos los órdenes
Figura 3. Alpha diversidad por polígono al orden q=0
Figura 4. Alpha diversidad por polígono al orden q=1
Figura 5. Alpha diversidad por polígono al orden q=2
BETA DIVERSIDAD
Fig 7. PCA’s todos los métodos
Fig 7. PCA’s todos los métodos
Fig 7. PCA’s todos los métodos
Fig 7. PCA’s todos los métodos
Fig 7. PCA’s todos los métodos
Fig 7. PCA’s todos los métodos
Fig 7. PCA’s todos los métodos
Fig 7. PCA’s todos los métodos
Fig 7. PCA’s todos los métodos
BETAPART - Turnover and Nestedness
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
Fig. 8 Betadsiper todos los métodos
BETAPART: temporal/season
Fig 9. Beta jaccard temporal
Fig 9. Beta jaccard recambio temporal
Fig 9. Beta jaccard nestedness temporal
ASIGNACIÓN TAXONÓMICA
Fig 10. Heatmap
Fig 10. Heatmap
